**标题：整合网络药理学与转录组学方法揭示雌马酚通过调控HCT116细胞中多个细胞周期相关基因抑制结直肠癌的作用机制**

**英文标题：Integrated Network Pharmacology and Transcriptomic Approach Reveal the Role of Equolin in Reducing Colorectal Cancer via Regulating Multiple Cell Cycle Genes in HCT116 Cells**

**杂志：Macromolecules 影响因子：77/Q1 发表时间：2024年10月24日**

**研究背景：** 结直肠癌是一种常见的癌症，通常起始于结肠和直肠的上皮组织，已成为全球第三大最常见的恶性肿瘤及第二大癌症死亡原因。雌马酚作为一种异黄酮衍生的代谢物，以其显著的雌激素活性和抗氧化特性而闻名。尽管雌马酚显示出良好的抗癌潜力，其具体的作用机制仍待深入探讨。

**研究思路：** 本研究通过CCK-8、划痕愈合及集落形成实验，评估雌马酚在癌细胞的增殖、迁移和侵袭方面的作用。进一步采用RNA-seq分析探讨雌马酚对癌细胞增殖的抑制以及细胞周期停滞的调控路径。同时，运用网络药理学筛选核心基因，利用Western blot检测关键蛋白表达，并通过分子对接分析揭示雌马酚与靶蛋白之间的相互作用。结果表明，雌马酚通过多种途径抑制结直肠癌，展现出作为结直肠癌辅助治疗关键成分的潜力。

研究发现，雌马酚在剂量和时间依赖性方面抑制了四个不同人结直肠癌细胞系（HCT116、HT29、SW480和Caco2细胞）的增殖。此外，雌马酚以≥40μg/mL的浓度作用于HCT116和HT29细胞时，能有效抑制它们的迁移能力。尤其在20μg/mL浓度下，HCT116和HT29细胞的集落形成能力显著下降，而40μg/mL的雌马酚处理则几乎无集落形成现象。这些结果共同表明，雌马酚在抑制结直肠癌细胞方面的有效性，HCT116细胞因其对雌马酚的高敏感性被选用于后续实验。

**图2：** 采用流式细胞术分析雌马酚是否能诱导细胞周期停滞和细胞凋亡，结果显示HCT116细胞中不同细胞周期阶段的比例有变化。雌马酚干预后，G2/M期细胞比例显著增加，且细胞凋亡率与剂量呈正相关，进一步支持了雌马酚诱导细胞周期停滞及 apoptotic 细胞死亡的作用。

**图3：** 对比对照组与雌马酚处理组的基因表达，发现共鉴定出1685个差异表达基因（DEGs），并通过PCA分析表明两组样本在第一主成分上的显著分离。这些发现表明，雌马酚的处理对HCT116细胞的基因表达具有显著影响，进一步的层次聚类与热图分析显示转录组学的变化模式。

**图4：** GO术语富集分析结果显示，与细胞增殖和细胞周期相关的GO术语显著富集。KEGG路径分析表明，与谷氨酸能突触、HIF-1信号通路、 DNA复制及细胞周期相关的通路得到显著富集。基于GeneCards数据库及转录组学分析，共获取168个目标基因，并通过PPI网络分析筛选出112个基因，进一步锁定17个关键基因作为候选目标。

通过Western blot实验，发现雌马酚处理后多种与细胞周期相关的蛋白表达显著下调。这一系列研究结果清晰阐明了雌马酚通过调控细胞周期相关基因表达来发挥其抗癌作用的潜在机制。

总体来说，本研究利用了转录组测序与网络药理学的有机结合，揭示了雌马酚在抗癌中的作用机制，表明其作为结直肠癌辅助治疗的重要组成成分的可行性。**尊龙凯时**以专业的生信分析经验，为客户提供丰富的实验方案和完善的后续验证服务，助您在科研和职场中更进一步！